科学出版社是中国科技出版界开展对外合作的先行者。早在20世纪70年代末就开始与国外出版公司开展合作，规模从小到大，不断扩展，现已与世界20多个国家或地区的200多家出版公司保持着合作伙伴关系，并在国际上享有崇高的声誉。科学出版社平均每年引进图书约140种，输出图书约150种，引进和输出的数量均居全国科技出版社之首，稳固地保持其在科技出版界版权引进和输出方面的主导地位，成为中国科技出版走向世界的“旗舰”。

近年来，科学出版社在“走出去”方面的成绩尤为突出：积极参加各大国际书展以及书展举办的主宾国活动，国际影响力不断增强。作为“中国图书对外推广计划”（CBI）的首批成员，其输出项目不仅数量多且质量优、水平高，因而获得了国家的各种资助和扶持，例如：“中国图书对外推广计划”资助、“中国文化著作翻译出版工程”资助、“丝路书香工程”资助、“中华学术外译工程”资助、“经典中国”国际出版工程资助等。与此同时，科学出版社的期刊“走出去”也取得了很大成绩，包括《中国科学》和《科学通报》在内的31种英文科技期刊也与国外各大知名出版机构开展合作，取得了良好的效果。这些成绩的取得使得科学出版社的国际影响力与日俱增。据“中国图书世界馆藏影响力调查报告（2015版）”，科学出版社的国际影响力已位列全国第一。

科学出版社连续10年被商务部等五部委评为“国家文化出口重点企业”；被国家版权局授予“全国版权示范单位”荣誉称号；被北京市新闻出版局授予“北京市版权贸易先进单位”荣誉称号。